बाद में सीबीआई टीम ने नागर को केन्द्रीय कारागार में प्रवेश करा दिया।
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सैद्धांतिक शिक्षा पूर्ण करने के बाद प्रायोगिक परीक्षा के रूप में एक आध क़त्ल कर के भारत सरकार के किसी अधिकृत विश्व विद्यालय-केन्द्रीय कारागार में प्रवेश लेते है.
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हालांकि वो थोड़ा निराश थी लेकिन उन्होंने इस निर्णय को ख़ुशी से और बहादुरी से लिया और कारागार में प्रवेश किया, कवि नाज़ुरल के प्रसिद्ध गीत “ ओह, इन लोहे की सलाखों को तोड़ दो, इन कारागारों को जला दो.. ” को गाते हुए..